Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmco5aQ9D9D5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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