Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9CYI0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms