Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Snx7Q9CY18 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Snx7Q9CY18 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Snx7Q9CY18 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Snx7Q9CY18 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Snx7Q9CY18 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Snx7Q9CY18 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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