Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9CXL3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9CXL3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms