Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RpainQ9CWY9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms