Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Smurf1Q9CUN6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Smurf1Q9CUN6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Smurf1Q9CUN6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Smurf1Q9CUN6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Smurf1Q9CUN6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Smurf1Q9CUN6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smurf1Q9CUN6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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