Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg3Q9CPX6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms