Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl17Q9CPR4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl17Q9CPR4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms