Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms