Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Tep1-201ENSMUST00000006444 8171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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