Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Vmn1r200Q8R281 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Vmn1r200Q8R281 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Vmn1r200Q8R281 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Vmn1r200Q8R281 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Vmn1r200Q8R281 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Vmn1r200Q8R281 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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