Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Brf1Q8CFK2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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