Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ercc8Q8CFD5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ercc8Q8CFD5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ercc8Q8CFD5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Ercc8Q8CFD5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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