Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdcl3Q8BVF2 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl3Q8BVF2 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms