Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ttc29Q80VM3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ttc29Q80VM3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ttc29Q80VM3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ttc29Q80VM3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ttc29Q80VM3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc29Q80VM3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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