Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Dsg1bQ7TSF1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Dsg1bQ7TSF1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Dsg1bQ7TSF1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Dsg1bQ7TSF1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Dsg1bQ7TSF1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Dsg1bQ7TSF1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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