Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms