Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphp3Q7TNH6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms