Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdcl2Q78Y63 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdcl2Q78Y63 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdcl2Q78Y63 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdcl2Q78Y63 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdcl2Q78Y63 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdcl2Q78Y63 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdcl2Q78Y63 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdcl2Q78Y63 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdcl2Q78Y63 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdcl2Q78Y63 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdcl2Q78Y63 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdcl2Q78Y63 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl2Q78Y63 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms