Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim12Q78RX3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms