Protein–RNA interactions for Protein: Q640N2

Arl13b, ADP-ribosylation factor-like protein 13B, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl13bQ640N2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl13bQ640N2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms