Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CttnQ60598 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms