Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

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Length 252 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf15Q5UBV8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms