Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Utp18Q5SSI6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Utp18Q5SSI6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Utp18Q5SSI6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Utp18Q5SSI6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Utp18Q5SSI6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Utp18Q5SSI6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms