Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms