Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Lrrc43Q3V0L5 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Lrrc43Q3V0L5 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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