Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prdm6Q3UZD5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Prdm6Q3UZD5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prdm6Q3UZD5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prdm6Q3UZD5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prdm6Q3UZD5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prdm6Q3UZD5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prdm6Q3UZD5 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prdm6Q3UZD5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Prdm6Q3UZD5 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Prdm6Q3UZD5 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prdm6Q3UZD5 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms