Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms