Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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