Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Nkx6-3Q3UHX8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Nkx6-3Q3UHX8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Nkx6-3Q3UHX8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Nkx6-3Q3UHX8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Nkx6-3Q3UHX8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Nkx6-3Q3UHX8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Nkx6-3Q3UHX8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms