Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtpbp6Q3U6U5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms