Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U6N9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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