Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Rnf149Q3U2C5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Rnf149Q3U2C5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Rnf149Q3U2C5 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Rnf149Q3U2C5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rnf149Q3U2C5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rnf149Q3U2C5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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