Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

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Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms