Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1aQ2LKU9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms