Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rpusd2Q149F1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rpusd2Q149F1 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rpusd2Q149F1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rpusd2Q149F1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd2Q149F1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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