Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc39dQ0VF76 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms