Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms