Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms