Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Msx2Q03358 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Msx2Q03358 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms