Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms