Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms