Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top2aQ01320 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms