Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms