Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Gabpb1Q00420 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Gabpb1Q00420 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gabpb1Q00420 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gabpb1Q00420 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Gabpb1Q00420 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gabpb1Q00420 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb1Q00420 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb1Q00420 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb1Q00420 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb1Q00420 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb1Q00420 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb1Q00420 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb1Q00420 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb1Q00420 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb1Q00420 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb1Q00420 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb1Q00420 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb1Q00420 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb1Q00420 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb1Q00420 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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