Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irx1P81068 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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