Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Aqp4P55088 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Aqp4P55088 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Aqp4P55088 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Aqp4P55088 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Aqp4P55088 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Aqp4P55088 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Aqp4P55088 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Aqp4P55088 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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Aqp4P55088 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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Aqp4P55088 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Aqp4P55088 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Aqp4P55088 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms