Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpargP37238 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpargP37238 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PpargP37238 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpargP37238 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PpargP37238 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpargP37238 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PpargP37238 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PpargP37238 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpargP37238 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpargP37238 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpargP37238 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpargP37238 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpargP37238 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpargP37238 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpargP37238 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpargP37238 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpargP37238 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PpargP37238 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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PpargP37238 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PpargP37238 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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PpargP37238 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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PpargP37238 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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PpargP37238 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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PpargP37238 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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PpargP37238 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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PpargP37238 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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PpargP37238 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PpargP37238 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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PpargP37238 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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