Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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