Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms